Genomic insights of Salmonella isolated from dry fermented sausage production chains in Spain and France
Visualitza/Obre
Autor/a
Yvon, Claire
Leclerc, Vincent
Leblanc, Jean-Charles
Corominas, Laura
Sabaté, Sara
Tolosa-Muñoz, Eva
Chacón-Villanueva, Carme
Cadel-Six, Sabrina
Data de publicació
2024-05-22ISSN
2045-2322
Resum
The presence of Salmonella in dry fermented sausages is source of recalls and outbreaks. The genomic diversity of 173 Salmonella isolates from the dry fermented sausage production chains (pig carcasses, pork, and sausages) from France and Spain were investigated through their core phylogenomic relationships and accessory genome profiles. Ten different serovars and thirteen sequence type profiles were identified. The most frequent serovar from sausages was the monophasic variant of S. Typhimurium (1,4,[5],12:i:-, 72%) while S. Derby was in pig carcasses (51%). Phylogenomic clusters found in S. 1,4,[5],12:i:-, S. Derby, S. Rissen and S. Typhimurium serovars identified closely related isolates, with less than 10 alleles and 20 SNPs of difference, displaying Salmonella persistence along the pork production chain. Most of the S. 1,4,[5],12:i:- contained the Salmonella genomic island-4 (SGI-4), Tn21 and IncFIB plasmid. More than half of S. Derby strains contained the SGI-1 and Tn7. S. 1,4,[5],12:i:- genomes carried the most multidrug resistance genes (91% of the strains), whereas extended-spectrum β-lactamase genes were found in Typhimurium and Derby serovars. Salmonella monitoring and characterization in the pork production chains, specially S. 1,4,[5],12:i:- serovar, is of special importance due to its multidrug resistance capacity and persistence in dry fermented sausages.
Tipus de document
Article
Versió del document
Versió publicada
Llengua
Anglès
Matèries (CDU)
663/664 - Aliments i nutrició. Enologia. Olis. Greixos
Pàgines
14
Publicat per
Nature Research
Publicat a
Scientific Reports
Citació
Ferrer-Bustins, Núria, Claire Yvon, Belen Martín, Vincent Leclerc, Jean-Charles Leblanc, Laura Corominas, Sara Sabaté, et al. 2024. “Genomic insights of Salmonella isolated from dry fermented sausage production chains in Spain and France”. Scientific Reports 14 (1). doi:10.1038/s41598-024-62141-9.
Número de l'acord de la subvenció
MICIU/Programa Estatal de I+D+I orientada a los retos de la sociedad/RTI2018-099195-R-I00/ES/EMBUTIDOS FERMENTADOS DE NUEVA GENERACION A TRAVES DE LA APLICACION DE MICROBIOLOGIA PREDICTIVA Y METODOLOGIAS OMICAS/
Programa
Funcionalitat i Seguretat Alimentària
Aquest element apareix en la col·lecció o col·leccions següent(s)
- ARTICLES CIENTÍFICS [2631]
Els següents fitxers sobre la llicència estan associats a aquest element:
Excepte que s'indiqui una altra cosa, la llicència de l'ítem es descriu com http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/