Detection and quantification of the toxic marine microalgae Karlodinium veneficum and Karlodinium armiger using recombinase polymerase amplification and enzyme-linked oligonucleotide assay
Visualitza/Obre
Autor/a
Toldrà, Anna
Jauset-Rubio, Míriam
Andree, Karl B.
Katakis, Ioanis
O'Sullivan, Ciara K.
Data de publicació
2018-07-28ISSN
0003-2670
Resum
Karlodinium is a dinoflagellate responsible for fish-killing events worldwide. In Alfacs Bay (NW Mediterranean Sea), the presence of two Karlodinium species (K. veneficum and K. armiger) with different toxicities has been reported. This work presents a method that combines recombinase polymerase amplification (RPA) with an enzyme-linked oligonucleotide assay (ELONA) to identify, discriminate and quantify these two species. The system was characterised using synthetic DNA and genomic DNA, and the specificity was confirmed by cross-reactivity experiments. Calibration curves were constructed using 10-fold dilutions of cultured cells, attaining a limit of detection of around 50,000 cells/L, far below the Karlodinium spp. alert threshold (200,000 cells/L). Finally, the assay was applied to spiked seawater samples, showing an excellent correlation with the spiking levels and light microscopy counts. This approach is more rapid, specific and user-friendly than traditional microscopy techniques, and shows great promise for the surveillance and management of harmful algal blooms.
Tipus de document
Article
Versió del document
Versió acceptada
Llengua
Anglès
Matèries (CDU)
63 - Agricultura. Silvicultura. Zootècnia. Caça. Pesca
Pàgines
19
Publicat per
Elsevier
Publicat a
Analytica Chimica Acta
Citació
Toldrà, Anna, Míriam Jauset-Rubio, Karl B. Andree, Margarita Fernández-Tejedor, Jorge Diogène, Ioanis Katakis, Ciara K. O'Sullivan, and Mònica Campàs. 2018. "Detection And Quantification Of The Toxic Marine Microalgae Karlodinium Veneficum And Karlodinium Armiger Using Recombinase Polymerase Amplification And Enzyme-Linked Oligonucleotide Assay". Analytica Chimica Acta 1039: 140-148. Elsevier BV. doi:10.1016/j.aca.2018.07.057.
Número de l'acord de la subvenció
MINECO/Programa Estatal de I+D+I orientada a los retos de la sociedad/BIO2017-87946-C2-2-R/ES/DISPOSITIVOS BIOANALITICOS PARA LA DETECCION RAPIDA Y RENTABLE DE GAMBIERDISCUS Y CIGUATOXINAS/CIGUASENSING
MINECO/Programa Estatal de I+D+I orientada a los retos de la sociedad/BIO2014-56024-C2-2-R/ES/MICROSISTEMAS PARA LA DETECCION RAPIDA, FIABLE Y RENTABLE DE MICROALGAS TOXICAS IN SITU Y A TIEMPO REAL/SEASENSING
Programa
Aigües Marines i Continentals
Aqüicultura
Aquest element apareix en la col·lecció o col·leccions següent(s)
- ARTICLES CIENTÍFICS [2549]
Els següents fitxers sobre la llicència estan associats a aquest element:
Excepte que s'indiqui una altra cosa, la llicència de l'ítem es descriu com http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/